“Tümör Sferoidlerin Anjiogenezinin ve İlaca Yanıtının İncelenmesi İçin 3 Boyutlu Hücre Kültürüne İzin veren Mikroakışkan Kartuş Geliştirilmesi” başlıklı, TÜBİTAK EEEAG destekli 1001 projesi, Prof. Dr. Kemal Baysal ve Prof. Dr. Alper Kiraz’ın laboratuvarlarında yürütülmektedir (2020-2023).

İn vitro üç-boyutlu ko-kültür ateroskleroz modelinin geliştirilmesi, geliştirilen modelde hücrelerden salınan ekzozomların RNA ve protein içeriklerinin karakterizasyonu ve ateroskleroz gelişimiyle ilişkili olduğu belirlenen eksozomların koroner arter hastalığının derecesi ile ilişkisinin incelenmesi

TUBİTAK SBAG 1001 projesi. (2021-2024)

Yürütücü: K. Baysal

Gastrik Tümör Sferoidlerinin Metabolizmasının NMR ile İncelenmesi

Koç Üniversitesi, Seed Fund destekli proje (2020- 2022)

Yürütücü: K. Baysal

Kardiyovasküler Hastalıklarda MikroRNAların Algılanmasına Yönelik Çoğullamalı Mikrofluidik Plazmonik Sensör Geliştirilmesi

TÜBİTAK-1001. (2021-2024)

Yürütücü: Dr. Berna Morova (Koç Üniversitesi, KUTTAM).

Kemal Baysal; iş paketi sorumlusu.

1. Hacettepe University Pharmacy Faculty Research on Gemcitabine
2. Hacettepe University Faculty of Biology Toxicology Department research on endocrine disruptors; DEHP mitochondria
3. İstanbul University Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Basic Medical Sciences, Medical Department of Biology research on diabetic rat aorta & pancreas, bone & liver
4. Research on Chitosan
5. Research on the Confocal microscope GSH measurement method
6. Research on liver GSH method confocal oxidative stress
7. Research Marmara University School of Medicine, Basic Medical Sciences, Department of Biophysics
8. ALS human and animal model
9. FeBr-GSH research Project
10. GBM Nanoparticle
11. Biochemistry of Diabetes
12. Biochemistry of aneurysm

• Scientific Industrial Projects

1. Duygu Aydemir, Seda Çakır, N. Nuray Ulusu. “Investigation of the anti-microbial properties of the triple enzyme-inorganic hybrid nanoflowers (TrpE@ihNFs) in comparison with chitosan” (Biyopol Arge (https://entertech.com.tr/firmalar/biyoteknoloji/biyopol-polimer-teknolojisi-arge-san-ve-tic-ltd-sti/en/)
2. Duygu Aydemir, Seda Çakır, N. Nuray Ulusu. “Investigation of chitosan on the wound healing in relation to the oxidative stress metabolism” (Biyopol Arge (https://entertech.com.tr/firmalar/biyoteknoloji/biyopol-polimer-teknolojisi-arge-san-ve-tic-ltd-sti/en/)
3. Duygu Aydemir, N. Nuray Ulusu. Development of spectrophotometric kits for enzymes involving in the pentose phosphate pathway and oxidative stress metabolism. (We are in touch with several companies).

II- Molecular Scientific Projects

1. Özge Balci, Duygu Agaogullari, Duygu Aydemir, Safacan Kolemen, Mehmet Somer, N. Nuray Ulusu, İsmail Lazoglu. Production of complex shaped titanium and zirconium oxide based ceramic composites containing metal borides, their microstructural/mechanical characterizations and investigation of biomedical applications. TUBITAK 1001 Ready to submit
2. Duygu Aydemir, İlker Eren, Mehmet Demirhan, N. Nuray Ulusu. Evaluation of the bioavailability and applicability of acellular dermal allografts in shoulder superior capsular reconstruction. Ready to submit
3. Prof. Dr. Zubeyde Erbayraktar, Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Prof. Dr. Serhat Erbayraktar, Duygu Aydemir. Dokuz Eylul University Department of Scientific Research Projects. Proteomic and mitochondrial genomic analysis of by comparative study of predictive, diagnostic, therapeutic and prognostic biomarkers panels in brain tumors. Starting date: 12.11.2017 (3 years). Dokuz Eylül üniversitesi ile ortak proje. Bilimsel araştırmalar koordinasyon birimi. Beyin Tümörlerinde prediktif, diyagnostik, terapotik ve prognostik biyobelirteç panellerinin proteomik ve mitokondriyal genomik analizler ile karşılaştırmalı araştırılması. Starting date: 12.11.2017 (3 years)
4. Prof. Dr. Ayse Nazli Başak, Prof. Dr. N. Nuray Ulusu, Prof. Dr. Kemal Turker, Prof. Dr. Selcuk Surucu, Duygu Aydemir, Betilay Topkara, M. Görkem Özyurt. Investigation of Biochemical biomarkers in Amyotrophic lateral sclerosis disease with the SOD1 mutations rat model. Starting date: 8.10.2017 (2 years)
5. Doç. Dr. Fatma Dagistanli, Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Merve Anapalı, Gamze Tanrıverdi, Duygu Aydemir, Turgut Ulutin, Ayşe Seda Akdemir. Influence of the resvaretrol and vitamin D treatment on the pancreas of the streptozotocin and fructose-induced rats. Project Number: TSA-2019-32274.
6. Turkey Scientific and Technological Institution (TUBITAK) Joint project Targeting molecular pathways of glycolipotoxicity by a novel carboxymethylated mercaptotriazinoindole inhibitor of aldo-keto reductase in diabetes, inflammation and age-related neurodegeneration Researcher Project number: 215S197 ‘215S197’ numaralı Starting date: 1-12.2015 (3 years)

III: Completed projects:

1. Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Dr. Kıvılcım Ozturk, Dr. Fatma Betül Arslan, Duygu Aydemir. Investigation of impact of the gemcitabine-loaded chitosan nanoparticles comparison with gemcitabine alone on the pancreatic cancer cell line CFPAC-1.
2. Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Prof. Dr. Yasemin Aksoy, Mehmet Ozcan, Duygu Aydemir. Protective Effect of Chlorophyllin as an Antioxidant on DNA Damage in the breast cancer.
3. Doç. Dr. Fatma Dagistanli, Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Merve Anapalı, Gamze Tanrıverdi, Duygu Aydemir, Turgut Ulutin, Ayşe Seda Akdemir. Influence of the resveratrol and vitamin D treatment on the pancreas of the streptozotocin and fructose-induced rats. Project Number: TSA-2019-32274 (2019-2020).
4. Prof. Dr. Erdem Alaca, Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Prof. Dr. Belma Turan, Duygu Aydemir. Investigation of biomechanical properties of rat aorta in relation with aging. May 2019- February 2020.
5. Prof. Dr. Erdem Alaca, Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Prof. Dr. Atıf Akçevin, Doç. Dr. Tijen Bozkaya, Duygu Aydemir. Investigation of biomechanical properties of human and in relation with cardiovascular diseases. Starting date: August 2019.
6. Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Doç. Dr. Nalan Özdemir, Dr. Firdevs Geçili, Duygu Aydemir. Synthesis and characterization of a triple enzyme-inorganic hybrid nanoflower (TrpE@ihNF) as a combination of three pancreatic digestive enzymes amylase, protease and lipase. (2018-2019).
7. Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Prof. Dr. Funda Havva Yağci Acar, Mahshid Hashemkhani, Duygu Aydemir. Investigation of biocompatibility, catalytic activity and efficacy of glutathione coated Ag2S quantum dots in vitro. (2018-2019)
8. Prof. Dr. Ayse Nazli Başak, Prof. Dr. N. Nuray Ulusu, Prof. Dr. Kemal Turker, Prof. Dr. Selcuk Surucu, Duygu Aydemir, Betilay Topkara, M. Görkem Özyurt. Investigation of Biochemical biomarkers in Amyotrophic lateral sclerosis disease with the SOD1 mutations rat model. Starting date: 8.10.2017 (3 years)
9. Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Prof. Dr. Erdem Alaca, Sedat Dogru, Duygu Aydemir. Impact of PDMS surface treatment and cell culture techniques in the cell-mechanics applications (2017-2020).
10. Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Prof. Dr. Nurhayat Barlas, Dr. Burcu Öztaşçı. Investigation of endocrine disrupting chemicals DEHP and butylparaben on the tissue damage in relation with oxidative stress metabolism in kidney, liver, brain, spleen and testis. (2017-2020).
11. Prof. Dr. Nuriye Nuray Ulusu, Dr. Gülsu Şimşek, Duygu Aydemir. Method optimization for measuring trace elements and minerals in the mammalian tissue and serum samples via ICP-MS (2017-2019).

1. Eser HY, Uymaz DS, Aygün MS, Yazıcı D, Kılıç Ö, İncir S. Obezitede Görülebilen Duygusal Düzenleme, Bilişsel Değişiklikler, Dürtü Kontrol Sorunları, Ödül Sistemindeki Bozuklukların Bariyatrik-Metabolik Cerrahi Öncesinde ve Sonrasında Değerlendirilmesi, İzlenmesi ve İlişkili Biyopsikososyal Risk Faktörlerinin Belirlenmesi. Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştirma Kurumu (Ankara) 10/2020-2022. Proje No: 120S586 Yürütücü: Hale Yapıcı Eser

2. İncir S, Öztürk AB, Nemutlu E, Yılmaz EA, Gelincik A, Nacaroğlu HT, Arga M, Sackesen İlaç Dışı Yollar ile (Beslenme Yolu ile) Salisilat Maruziyeti ile Kronik Ürtiker İlişkisinin in vivo ve in vitro Araştırılması. Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştirma Kurumu (Ankara) 11/2019-2020 Proje No: 119S348 Yürütücü: Said İncir

3. Erus S, Öztürk AB, Albayrak Ö, İncir S, Kapdağlı MH, Cesur EE, Yavuz Ö, Tanju S, Dilege Ş. Robotik ve Torakoskopik Akciğer Rezeksiyonlarının Postoperatif İnflamasyon Belirteçleri ve Stres Hormonları Üzerine Etkisi. Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştirma Kurumu (Ankara) 10/2018-01/2020 Proje No: 118S779 Yürütücü: Suat Erus

4. Öztürk AB, İncir S, Yüksel Ö, Gümüşburun R, Saçkesen C. Diyet ile Alınan Salisilatın Aspirin Duyarlı Astımlılarda Hastalık Kontrolüne Etkisi. Destekleyen: Türk Toraks Derneği. 2019 Yürütücü: Ayşe Bilge Öztürk

5. Aslan G, Afsar B, Sag AA, Camkiran V, Erden N, Yilmaz S, İncir S, Kanbay M. İdrar pH ve Üriner Ürik Asit Düzeylerinin Kontrast Nefropatinin Gelişimine Etkisi. Koç University Seed Research Program Support /2017 Yürütücü: Mehmet Kanbay